Morie Yoshiyuki

Researcher Information

Affiliation

Department of Medical Technology Associate Professor

Degree

• Ph.D（Engineering）

Research Interests

• High Performance Computing   Communication   Network   

Research Areas

• Informatics / Computer systems
• Informatics / High-performance computing
• Informatics / Information networks

Academic & Professional Experience

• 2019/04 - Today  Teikyo UniversityFaculty of Fukuoka Medical Technology Department of Medical TechnologyLecturer
• 2017/04 - 2019/03  RIKENAdvanced Institute for Computational ScienceResearch Scientist
• 2011/10 - 2017/03  Kyushu UniversityResearch Institute for Information TechnologyPostal doctor
• 2008/04 - 2010/03  Institute of Systems, Information Technologies and Nanotechnologies (ISIT)Postal doctor

Association Memberships

• IEEE Computer Society   INFORMATION PROCESSING SOCIETY OF JAPAN   

Research Activity Information

Published Papers

• Data Transfer API and its Performance Model for Rank-Level Approximate Computing on HPC Systems

  Yoshiyuki Morie; Yasutaka Wada; Ryohei Kobayashi; Ryuichi Sakamoto

  International Journal on Networking and Computing (IJNC) IJNC Editorial Committee 13 (1) 48 - 61 2185-2839 2023/01 [Refereed]
  
• Performance Evaluation of Data Transfer API for Rank Level Approximate Computing on HPC Systems.

  Yoshiyuki Morie; Yasutaka Wada; Ryohei Kobayashi; Ryuichi Sakamoto

  IPDPS Workshops 445 - 448 2022 [Refereed]
  
• Design of a Flexible In Situ Framework with a Temporal Buffer for Data Processing and Visualization of Time-Varying Datasets.

  Kenji Ono; Jorji Nonaka; Hiroyuki Yoshikawa; Takeshi Nanri; Yoshiyuki Morie; Tomohiro Kawanabe; Fumiyoshi Shoji

  High Performance Computing - ISC High Performance 2018 International Workshops, Frankfurt/Main, Germany, June 28, 2018, Revised Selected Papers 11203 243 - 257 0302-9743 2018/06 [Refereed]
  
• Prototyping of offloaded persistent broadcast on tofu2 interconnect

  Y. Morie; M. Hatanaka; M. Takagi; A. Hori; Y. Ishikawa

  SC17 Technical Posters 2017/11 [Refereed]
  
• Effective Calculation with Halo communication using Halo Functions

  Keiichiro Fukazawa; Toshiya Takami; Takeshi Soga; Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  PROCEEDINGS OF THE 23RD EUROPEAN MPI USERS' GROUP MEETING (EUROMPI 2016) 215 - 216 2016 [Refereed]
  
• Memory Efficient One-Sided Communucation Library "ACP" in Globary Memory on Raspberry Pi 2

  Yoshiyuki Morie; Hiroaki Honda; Takeshi Nanri; Taizo Kobayashi; Hidetomo Shibamura; Ryutaro Susukita; Yuichiro Ajima

  PROCEEDINGS 2016 IEEE 36TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON DISTRIBUTED COMPUTING SYSTEMS ICDCS 2016 761 - 762 1063-6927 2016 [Refereed]
  
• NSIM-ACE: An Interconnection Network Simulator for Evaluating Remote Direct Memory Access.

  Ryutaro Susukita; Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri; Hidetomo Shibamura

  Proceedings of the 6th International Conference on Simulation and Modeling Methodologies, Technologies and Applications (SIMULTECH 2016), Lisbon, Portugal, July 29-31, 2016. SciTePress 254 - 261 2016 [Refereed]
  
• A Neighboring Communication Algorithm Using Effective Multiple Communication Devices on Direct Connection Network

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  IPSJ Transactions on Advanced Computing System 8 (4) 26-35 (WEB ONLY)  1882-7829 2015/11 [Refereed]
  
• Performance Evaluation of RDMA Communication Patterns by Means of Simulations

  Ryutaro Susukita; Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri; Hidetomo Shibamura

  PROCEEDINGS OF THE 2015 JOINT INTERNATIONAL MECHANICAL, ELECTRONIC AND INFORMATION TECHNOLOGY CONFERENCE (JIMET 2015) 10 141 - 147 2352-538X 2015 [Refereed]
  
• Channel Interface: a Primitive Model for Memory Efficient Communication

  Takeshi Nanri; Takeshi Soga; Yuichiro Ajima; Yoshiyuki Morie; Hiroaki Honda; Taizo Kobayashi; Toshiya Takami; Shinji Sumimoto

  23RD EUROMICRO INTERNATIONAL CONFERENCE ON PARALLEL, DISTRIBUTED, AND NETWORK-BASED PROCESSING (PDP 2015) 177 - 181 2015 [Refereed]
  
• Development of RDMA-based Communication Middleware Library for Molecular Orbital Program

  Hiroaki Honda; Yuichi Inadomi; Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri; Toshiya Takami

  J Comput Chem Jpn (Web) Society of Computer Chemistry, Japan 13 (6) 335-336(J-STAGE) - 336 1347-3824 2014 [Refereed]
  
• Implementation of Neighbor Communication Algorithm Using Multi-NICs Effectively by Extended RDMA Interface

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  SC13 Technical Posters 1 - 2 2013/11 [Refereed]
  
• Task Allocation Technique for Avoiding Contentions on Multi-dimensional Mesh/Torus

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  IPSJ Transactions on Advanced Computing System (Web) 6 (3) 12-21 (WEB ONLY)  1882-7829 2013/09 [Refereed]
  
• A Neighbor Communication Algorithm with Making an Effective Use of NICs on Multidimensional-Mesh/torus

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  International Conference on Simulation Technology (JSST2013) JSST2013 1 - 2 2013/09 [Refereed]
  
• 多次元メッシュ/トーラスにおける通信衝突を考慮したタスク配置最適化技術

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  2013 HPCS : High Performance Computing Symposium 2013 95 - 103 2013/01 [Refereed]
  
• Task allocation optimization for neighboring communication on fat tree

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri

  Proceedings of the 14th IEEE International Conference on High Performance Computing and Communications, HPCC-2012 - 9th IEEE International Conference on Embedded Software and Systems, ICESS-2012 IEEE Computer Society 1219 - 1225 2012 [Refereed]
  
• Task allocation method for avoiding contentions by the information of concurrent communications

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri; Motoyoshi Kurokawa

  Proceedings of the 10th IASTED International Conference on Parallel and Distributed Computing and Networks, PDCN 2011 62 - 69 2011 [Refereed]
  
• A method for predicting a penalty of contentions by considering priorities of routing among packets on direct interconnection network

  Yoshiyuki Morie; Takeshi Nanri; Ryutaro Susukita

  Proceedings - 4th International Joint Conference on Computational Sciences and Optimization, CSO 2011 263 - 267 2011 [Refereed]
  
• SMMH - A Parallel Heuristic for Combinatorial Optimization Problems

  Domingues, Guilherme;; Morie, Yoshiyuki ;; Research Institute for Information Technology, Kyushu University (Japan)];; Gu, Feng Long;; Nanri, Takeshi ;; Murakami, Kazuaki ;; Department of Informatics, Kyushu University (Japan)]

  AIP Conference Proceedings 2 40 - + 0094-243X 2007/12 [Refereed]
  
• Research on optimization of task allocation for reducing contention

  Yoshiyuki Morie; Naoki Sueyasu; Toru Matsumoto; Takeshi Nanri; Hiroaki Honda; Koji Inoue; Kazuaki Murakami

  Symposium on Next Generation SuperComputing 2007 2007 2007/10 [Refereed]
  
• Optimization of MPI Rank Allocation Considering Communication Timing for Reducing Contention

  Yoshiyuki Morie; Naoki Sueyasu; Toru Matsumoto; Takeshi Nanri; Hiroaki Ishihata; Koji Inoue; Kazuaki Murakami

  情報処理学会論文誌 48 (SIG13(ACS19)) 192 - 202 0387-5806 2007/08 [Refereed]
  
• Optimization of MPI rank allocation considering communication timing for reducing contention

  Yoshiyuki Morie; Naoki Sueyasu; Toru Matsumoto; Takeshi Nanri; Hiroaki Ishihata; Koji Inoue; Kazuaki Murakami

  情報処理学会シンポジウム論文集 2007 (5) 283 - 292 1344-0640 2007/05 [Refereed]
  
• SMMH - A parallel heuristic for combinatorial optimization problems

  Guilherme Domingues; Yoshiyuki Morie; Feng Long Gu; Takeshi Nanri; Kazuaki Murakami

  COMPUTATION IN MODERN SCIENCE AND ENGINEERING VOL 2, PTS A AND B 2 1195 - + 0094-243X 2007 [Refereed]
  

MISC

• 細粒度なApproximate Computing適用に向けた演算精度変更による影響の評価

  和田康孝; 森江善之; 小林諒平; 坂本龍一  情報処理学会研究報告(Web)  2023-  (HPC-191)  2023
• Castと通信の並列実行のための予備実験

  森江善之; 和田康孝; 小林諒平; 坂本龍一  情報処理学会研究報告(Web)  2023-  (HPC-191)  2023
• ECMOにおける送気圧力からみた人工肺の寿命予測の可能性について

  馬場伸高; 蛯原朋香; 関原琢也; 輪内敬三; 森江善之; 廣浦学  体外循環技術  49-  (3)  2022
• 超大規模並列計算時代における通信機構「N-STDIO」のポスト処理利用

  森江 善之; 本田 宏明; 柴村 英智; 南里 豪志  情報処理学会研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング(HPC)  2021-HPC-182-  1  -6  2021/12
• 演算精度の動的制御によるApproximate Computingの実現に向けた予備評価

  和田 康孝, 小林 諒平, 坂本 龍一, 森江 善之  情報処理学会研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング(HPC)  2021-HPC-181-  (2)  1  -6  2021/09
• 遠隔講義における実習・演習の事例

  森江 善之  BoF, サイエンティフィック・システム研究会  2021/01
• Open Fabrics InterfacesオフロードAPIを用いたMPI永続型集団通信の設計と評価

  森江善之; 畑中正行; 高木将通; 堀敦史; 石川裕  情報処理学会研究報告(Web)  2019-  (HPC-168)  Vol.2019‐HPC‐168,No.3,1‐8 (WEB ONLY)  2019/02
• マルチタスクPGASモデルをサポートするノード間軽量通信レイヤの検討

  小田嶋哲哉; 森江善之; 李珍泌; 佐藤三久  情報処理学会研究報告(Web)  2019-  (HPC-168)  Vol.2019‐HPC‐168,No.1,1‐7 (WEB ONLY)  2019/02
• Evaluation of Intra Node of Persistent Collective Communication using NIC Offloading

  森江善之; 畑中正行; 高木将通; 堀敦史; 石川裕  情報処理学会研究報告(Web)  2018-  (HPC-165)  Vol.2018‐HPC‐165,No.11,1‐7 (WEB ONLY)  2018/07
• FX100における永続型集団通信関数のプロトタイプ実装と評価

  森江善之; 畑中正行; 高木将通; 堀敦史; 石川裕; 南里豪志  情報処理学会研究報告(Web)  2018-  (HPC-163)  Vol.2018‐HPC‐163,No.12,1‐7 (WEB ONLY)  2018/02
• Development of Effective Halo Communication and Calculation Model on Stencil Computation

  深沢圭一郎; 森江善之; 曽我武史; 高見利也; 南里豪志  情報処理学会研究報告(Web)  2016-  (HPC-153)  VOL.2016‐HPC‐153,NO.7 (WEB ONLY)  2016/02
• ACPライブラリの通信性能およびメモリ使用量の評価

  森江善之; 本田宏明; 南里豪志  情報処理学会研究報告(Web)  2016-  (HPC-153)  VOL.2016‐HPC‐153,NO.24 (WEB ONLY)  2016/02
• ACPライブラリによるMPI_Comm_spawnの置き換えとOpenFMOへの適用

  本田宏明; 森江善之; 南里豪志; 稲富雄一; 高見利也; 本田宏明; 森江善之; 南里豪志; 稲富雄一; 高見利也  情報処理学会研究報告(Web)  2016-  (HPC-153)  VOL.2016‐HPC‐153,NO.31 (WEB ONLY)  2016/02
• ACP通信ライブラリを用いたOpenFMOプログラムの実装

  本田宏明; 森江善之; 南里豪志; 稲富雄一; 高見利也  日本コンピュータ化学会年会講演予稿集  2015-  66‐67  2015/10
• Effects of Halo Thread to the Magnetohydrodynamic Simulation toward Exascale Computing

  深沢圭一郎; 森江善之; 曽我武史; 高見利也; 南里豪志; 深沢圭一郎; 森江善之; 曽我武史; 高見利也; 南里豪志  情報処理学会研究報告(Web)  2015-  (HPC-151)  VOL.2015-HPC-151,NO.23 (WEB ONLY)  2015/09
• Interconnection Network Simulation of Synchronization Communication in RDMA

  薄田竜太郎; 森江善之; 南里豪志; 柴村英智  電子情報通信学会技術研究報告  115-  (174(CPSY2015 16-44))  71  -78  2015/07
• Implementation and Evaluation of ACP Basic Layer of InfiniBand

  Y. Morie; T. Nanri; Y. Ajima; H. Hond; T. Soga; T. Kobayashi; S. Sumimoto  Proc. of International Workshop on Information Technology, Applied Mathematics and Science (IMS2015)  2015-  (HPC-148)  105  -110  2015/03
• Implementation and Evaluation of ACP Basic layer

  森江善之; 南里豪志; 安島雄一郎; 本田宏明; 曽我武史; 小林泰三; 住元真司; 森江善之; 南里豪志; 安島雄一郎; 本田宏明; 曽我武史; 小林泰三; 住元真司  情報処理学会研究報告(Web)  2015-  (HPC-148)  VOL.2015-HPC-148,NO.33 (WEB ONLY)  -6  2015/02
• ACPライブラリの集団通信インターフェース

  本田宏明; 山田博厚; 森江善之; 南里豪志; 高見利也  情報処理学会研究報告(Web)  2015-  (HPC-148)  VOL.2015-HPC-148,NO.34 (WEB ONLY)  -6  2015/02
• 分子軌道法プログラムでの利用に向けたACP通信ライブラリによる集団通信の実装

  本田宏明; 森江善之; 南里豪志; 稲富雄一; 高見利也  日本コンピュータ化学会年会講演予稿集  2015-  51  -52  2015
• NSIM-ACE: A Simulator for Evaluating RDMA on Large-Scale Interconnection Networks

  薄田竜太郎; 森江善之; 南里豪志; 柴村英智  情報処理学会研究報告(Web)  2014-  (ARC-213)  VOL.2014-ARC-213,NO.31 (WEB ONLY)  2014/12
• 分子軌道法に向けたRDMAに基づく通信ミドルウエアの開発

  本田宏明; 稲富雄一; 森江善之; 南里豪志; 高見利也  日本コンピュータ化学会年会講演予稿集  2014-  51  -52  2014/10
• Topology Aware Performance Prediction of Collective Communication Algorithms on Multi-Dimensional Mesh/Torus

  H. Sugiyama; Y. Morie; T. Nanri  Bulletin of Networking, Computing, Systems, and Software  3-  (1)  29  -33  2014/01
• A Bottleneck and Cooperation with the Post Processes in Numerical Calculation of Transient Phenomena

  小林泰三; 森江善之; 高見利也; 青柳睦  情報処理学会研究報告(Web)  2013-  (ARC-207)  VOL.2013-ARC-207,NO.23 (WEB ONLY)  -7  2013/12
• An implementation of neighbor communication utilizing effectively multi-NICs on multi-dimensional mesh

  Y. Morie; T. Nanri  今後のHPC（基盤技術と応用）に関するワークショップ  49  -52  2013/12
• Proposal of a Method for Selecting Algorithm of Collective Communications on Multi-Dimensional Mesh/Torus

  南里豪志; 杉山裕宣; 森江善之  情報処理学会研究報告(CD-ROM)  2012-  (6)  ROMBUNNO.HPC-138,NO.11  2013/04
• 通信衝突を削減するタスク配置最適化における通信タイミングの予測方式の影響

  森江善之; 南里豪志  情報処理学会研究報告(CD-ROM)  2012-  (5)  ROMBUNNO.ARC-202,NO.35  2013/02
• 連成・連携計算による総計算時間の評価

  押川雄大; 小林泰三; 森江善之; 高見利也; 青柳睦  ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集  2012-  57  -57  2012/01
• 隣接通信に対する通信衝突を考慮した通信性能向上のためのタスク配置最適化の評価

  森江善之; 南里豪志  ハイパフォーマンスコンピューティングと計算科学シンポジウム論文集  2012-  82  -82  2012/01
• Coupled and Cooparated Simulation for Reduction of Data Amount

  押川雄大; 小林泰三; 森江善之; 高見利也; 青柳睦  情報処理学会研究報告(CD-ROM)  2011-  (4)  ROMBUNNO.ARC-197,NO.4  2011/12
• Coupled and Cooparated Simulation on Heterogeneous Parallel Computing Environment

  押川雄大; 小林泰三; 森江善之; 高見利也; 青柳睦  情報処理学会研究報告(CD-ROM)  2011-  (2)  ROMBUNNO.HPC-130,NO.20  2011/08
• Evaluation of optimization of task allocation for reducing contentions

  森江善之; 南里豪志; 石畑宏明; 井上弘士; 村上和彰  情報処理学会研究報告  2008-  (19(ARC-177 HPC-114))  79  -84  2008/03
• Optimization of rank allocation considerin communication timing

  森江善之; 末安直樹; 松本透; 南里豪志; 石畑宏明; 井上弘士; 村上和彰  情報処理学会研究報告  2007-  (17(ARC-172 HPC-109))  145  -150  2007/03
• Vulcan: An example of Redefis

  橋永寿彦; 首藤真; 松尾拓真; 森江善之; GAUTHIER L; 村上和彰  電子情報通信学会技術研究報告  104-  (475(CPSY2004 25-31))  13  -18  2004/11
• Development Environment for Redefis

  松尾拓真; 首藤真; 橋永寿彦; 森江善之; GAUTHIER L; 村上和彰  電子情報通信学会技術研究報告  104-  (475(CPSY2004 25-31))  19  -24  2004/11
• Redefis: A SoC Design Platform

  首藤真; 松尾拓真; 橋永寿彦; 森江善之; GAUTHIER L; 村上和彰  電子情報通信学会技術研究報告  104-  (475(CPSY2004 25-31))  7  -12  2004/11
• Behavior level description and Transformation pointed to efficiency in Behavioral synthesis

  森江善之; 冨山宏之; 村上和彰  電子情報通信学会技術研究報告  103-  (480(DC2003 34-77))  67  -72  2003/11

Research Grants & Projects

• 動的なデータ精度調整可能な通信ライブラリの開発

  日本学術振興会：科学研究費助成事業

  Date (from‐to) : 2025/04 -2028/03 

  Author : 森江 善之; 坂本 龍一
• Development of a communication scheme for many site coupled calculations

  Japan Society for the Promotion of Science：Grants-in-Aid for Scientific Research

  Date (from‐to) : 2014/04 -2017/03 

  Author : KOBAYASHI Taizo; MUNETOMO Masaharu; JITSUMOTO Hideyuki; TAKAMI Toshiya; NANRI Takeshi; MORIE Yoshiyuki

Teaching Experience

Engineering of Medical SystemsEngineering of Medical Systems Teikyo University
Life Design Seminar ⅠLife Design Seminar Ⅰ Teikyo University
Foundation of Clinical Engineering Seminar ⅠFoundation of Clinical Engineering Seminar Ⅰ Teikyo University
Fundamental Mathematics IIFundamental Mathematics II Teikyo University
Fundamental Mathematics IFundamental Mathematics I Teikyo University
Mechanical Engineering IMechanical Engineering I Teikyo University
Applied MathematicsApplied Mathematics Teikyo University
Mechanical Engineering ⅡMechanical Engineering Ⅱ Teikyo University
Applied PhysicsApplied Physics Teikyo University
Medical PhysicsMedical Physics Teikyo University
Information Processing: Exercise IIInformation Processing: Exercise II Teikyo University
Information Technology IIInformation Technology II Teikyo University
Medical StaticsMedical Statics Teikyo University
Information Processing: Exercise IInformation Processing: Exercise I Teikyo University
Information technology IInformation technology I Teikyo Univsersisty
Practice ProgrammingPractice Programming Teikyo University
Fundamental MathematicsFundamental Mathematics Teikyo University
Medical Information Processing: Exercise IIMedical Information Processing: Exercise II Teikyo University
Medical Information Processing: Exercise IMedical Information Processing: Exercise I Teikyo University